斯凱普林管道公司在挖掘地下時偶然打通了兩個世界的管道，讓馬里奧（鮑勃·霍斯金斯 Bob Hoskins 飾）和魯基（約翰·雷吉扎莫 John Leguizamo 飾）兄弟有機會進入另一個由庫帕（丹尼斯·霍珀 Dennis Hopper 飾）控制的世界。 　　庫帕運用他的機器，可以隨意改變生物的進化或退化，而戴西（薩曼莎·瑪西絲 Samantha Mathis 飾）被抓後，她成爲統一兩個世界的關鍵。隕石碎片成爲了爭奪的焦點。兄弟二人展現出他們作爲管道工的技能，利用自己的能力幫助戴西，使她能夠使用隕石碎片使父親復原，並且穩定混亂的局勢。馬里奧和魯基兄弟通過發揮各自的所長，助力戴西實現目標，同時也爲兩個世界的和平作出了貢獻。